狼尾草和狗尾巴草虽然外形相似，常被误认为是同一种植物，但它们在植物分类、形态特征、生态习性及用途等方面存在明显区别。
首先，从植物分类上看，狼尾草属于禾本科狼尾草属，而狗尾巴草则属于禾本科狗尾草属。二者虽同科不同属，亲缘关系较远。
其次，在形态特征上差异显著。狼尾草植株较高大，通常高60–120厘米，茎秆粗壮直立。其花序为密集的圆柱状穗状花序，长约5–20厘米，颜色多为紫红色或淡褐色，质地柔软蓬松，形似狼尾，故得名。而狗尾巴草植株较矮小，一般高30–60厘米，茎细弱。花序为绿色或黄绿色的圆柱形穗状花序，长约2–15厘米，表面密布细软刚毛，摸起来略粗糙，整体更像小狗摇摆的尾巴。
再者，生态习性也不同。狼尾草多生长于山坡、林缘、河岸等较为肥沃湿润的环境中，具有较强的耐旱、耐寒和抗逆能力，常被用作园林观赏草或水土保持植物。狗尾巴草则常见于农田、路边、荒地等受干扰较多的生境，是一种典型的农田杂草，繁殖力强，适应性广，但经济价值较低。
最后，在用途方面，狼尾草因其观赏性强、株型优美，广泛用于园林绿化、花境配置，部分品种还可作为牧草或生物质能源植物。而狗尾巴草虽偶有药用记载（如清热明目），但主要被视为杂草，对农作物有一定竞争抑制作用。
